Процесс информатизации в Когалымской городской больнице начался в 1996 году с внедрением автоматизированной информационной системы обязательного медицинского страхования (АИС ОМС).
С развитием АИС ОМС продолжилась автоматизация больничного комплекса. Для обслуживания большого количества программных продуктов в 2007 году в медучреждении была создана группа информационного обеспечения. В 2011 году группа информационного обеспечения была реорганизована в отдел медицинских информационных технологий.
На сегодняшний день в больнице свыше 150 компьютеров объединены в единую локальную вычислительную сеть, 115 из них подключены к медицинской информационной системе, в составе которой более 25 программных комплексов. Кроме того, в больнице используют систему «Телемедицина» для консультаций со специалистами других медицинских учреждений.