Патологоанатомическое отделение Когалымской городской больницы начало свою работу в 1986 году и располагалось на тот момент в небольшой комнате площадью всего 12 кв.м.
Летом 1987 года было построено типовое одноэтажное здание для патологоанатомического отделения и судмедэкспертизы. В 2002 году вступило в строй новое здание патологоанатомической службы, на базе которой функционирует патологоанатомический музей.
На сегодняшний день отделение оснащено современным оборудованием, которое позволяет качественно и быстро проводить исследования за счет полной автоматизации процесса. В отделении применяются современные унифицированные методы окраски, необходимые для постановки диагноза.
Ежегодно в отделении проводится свыше 21 000 патогистологических исследований с использованием более 11 гистологических окрасок.